Descripción
La misión de la Unidad de Bioinformática, creada en mayo de 2023, es proporcionar apoyo de análisis computacional que permita a los investigadores acceder a soluciones eficaces a la hora de analizar, visualizar e interpretar sus datos, englobando las diferentes necesidades tecnológicas asociadas a la ciencia de datos.
Para conseguir estos objetivos, la unidad está implicada en el asesoramiento a científicos e investigadores sobre las posibilidades y beneficios que se obtienen de la aplicación de la bioinformática y la biología computacional en sus investigaciones en el entorno actual de big data.
La unidad maneja principalmente, pero no exclusivamente, datos genómicos, ya sean de origen humano o de animales modelo. Hasta ahora, se han implementando plataformas (pipelines) para llevar a cabo los análisis más comunes relacionados con datos genómicos.
La unidad, pretende tener una continua expansión y actualización, mejorando los servicios ofertados actualmente, así como incorporando nuevos protocolos y servicios basados en las nuevas necesidades de un campo en continua expansión como es la ciencia de datos.
Esta unidad pertenece a la red transbionet https://inb-elixir.es/transbionet
- Responsable de la Unidad: Rafael Muñoz Viana
- Correo electrónico: rmviana@idiphim.org
- Asesoría científica:
- Diseño experimental en proyectos de secuenciación
- Ingeniería de datos:
- Curado de bases de datos
- Análisis Bioinformáticos:
- Microbioma con 16S
- Exomas completos (WES)
- Epigenética con immunoprecipitación de cromatina (ChIP-seq)
- Epigenética con ATAC-seq
- Epigenética con MNase-seq
- Transcriptómica (RNA-seq)
- Transcriptómica de celula unica (scRNA-seq)
- Transcriptómica espacial para plataforma visiumx10 (ST-seq)
- Estudios de genómica funcional
- Según estudio y objetivos
- Ciencia de datos
- Machine Learning según estudio y objetivos
- Formación
- Introducción a la Programación en R
- Genética y Genómica humana